Mottaksordningen skal legge til rette for at avfall fra skip blir samlet inn og utsortert på en måte som legger til rette for ombruk og materialgjenvinning.

Forurensningsforskriften kapittel 20 stiller ikke spesifikke krav til hvordan slik utsortering skal foregå, utover at mottaksordningen skal være tilpasset det normale behovet for levering av avfall i havnen. Omfanget av utsorteringen vil avhenge av type og mengde avfall som normalt leveres i havnen. Dette er beskrevet i Avfallsforskriften kapittel 10 a.

Dersom havnen anløpes av fartøy i internasjonal trafikk gjelder egne regler for håndtering av matavfall fra disse fartøyene. Mattilsynet er myndighet for dette.

Avfall fra fartøy omfatter også oppfisket avfall, altså avfall som er samlet i redskaper under fangstvirksomhet.

Fiskefartøy skal kunne levere oppfisket avfall i havnen

Havneansvarlig må sørge for at mottaket er tilpasset dette. Mottaksordningene skal også legge til rette for at oppfisket avfall blir samlet inn og utsortert på en måte som tilrettelegger for ombruk og materialgjenvinning.

Havnen kan ikke kreve direkte gebyr for mottak av oppfisket avfall. Kostnadene havnen har med å håndtere dette avfallet skal dekkes gjennom det generelle avfallsgebyret.

For fiskeutstyr som inneholder plast gjelder kapittel 7B i avfallsforskriften. 

God og tilgjengelig informasjon er viktig for at mottaksordningen skal fungere effektivt. Derfor har havnen ansvar for å gjøre informasjon lett tilgjengelig for alle brukere.

I forskriften finnes det en liste over hvilke opplysninger som skal gjøres tilgjengelig, både på norsk og engelsk. Vanlige kanaler for dette er havnas nettsider og fysiske oppslag i området.

Etter levering av avfall skal havneansvarlig fylle ut en avfallskvittering i samsvar med forurensningsforskriften vedlegg IV og utstede denne uten unødig forsinkelse. Dersom avfall leveres direkte til renovatør i havnen, kan renovatøren bistå den havneansvarlige med å framskaffe kvittering for dette avfallet. 

Små havner med ubetjente mottaksordninger eller som ligger avsides til, har ikke plikt til å levere avfallskvittering, så lenge disse er registrert med navn og beliggenhet i SafeSeaNet Norway.      

En sentral del av vurderingen av hvilke havner som er små er antall meldepliktige skip som anløper havnen. Havner som har ti eller færre anløp av meldepliktige skip årlig, vil som regel oppfylle vilkåret.  

Havneansvarlig må i forbindelse med godkjenning av avfallsplan vise at havnen oppfyller vilkårene for unntak. Statsforvalteren skal vurdere om vilkårene for unntak er oppfylt basert på opplysningene havnen oppgir om mottaksordningen, antall anløp og beliggenhet. Statsforvalteren melder inn hvilke havner som oppfyller vilkårene for unntak til Miljødirektoratet, som sørger for at dette blir registrert i SafeSeaNet Norway.